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服務介紹應用案例

PRM靶向定量蛋白檢測 * 實驗原理


PRM(平行反應監視,parallel reaction monitoring)是目前靶向定量蛋白質組學的主流方法之一。利用四級桿質量分析器選擇性的檢測目標肽段的母離子信息,隨后在HCD碰撞池中發碎裂,最后進入高分辨率、高質量精度的Orbitrap分析器中,檢測所選擇的母離子窗口內的所有碎片離子信息,這樣即可對復雜樣本中的目標蛋白/肽段進行特異性的定量分析。





PRM靶向定量蛋白檢測 * 檢測流程


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PRM靶向定量蛋白檢測 * 技術應用


1、驗證高通量定量蛋白質組學(如iTRAQTMTSILACLabel free)的實驗結果
2、對目標蛋白質相對或絕對定量分析

 





PRM靶向定量蛋白檢測 * 輝駿服務優勢

1

十年服務經驗,客戶成果發表在NatureMethods,Oncogene,Cell Research等高水平期刊上。


2

對蛋白篩選與定量方面有獨到見解,擅長針對客戶情況提出合適的方案建議


3

自有分子及細胞生物實驗平臺,能有效制定并執行最優的實驗路線。


4

售后技術支持將一直保持到客戶發表文章,確保客戶安心進行下游實驗及投稿


 

聯系技術支持
18927549347





PRM靶向定量蛋白檢測 * 服務信息



項目名稱

客戶提供

結果交付

實驗周期

價格

PRM

原始樣本(-80℃保存,干冰運輸)

樣本信息表

分析要求
 

1、全譜檢測結果
2、PRM定量用目標肽段及子離子列表
3、PRM預實驗結果
4、PRM正式實驗結果
5、質譜原始數據
6、實驗報告

5-6周






PRM靶向定量蛋白檢測 * 客戶文獻


1. Lisa H.et al: Development of a Parallel Reaction Monitoring Mass Spectrometry Assay for the Detection of SARS-CoV?2 Spike Glycoprotein and Nucleoprotein.Analytical Chemistry.2018,IF=4.402.
【研究內容】:研究者采用數據獨立采集(DIA)定量質譜法對20例接受培美曲塞/鉑類化療的晚期肺腺癌患者的血清標本進行分析,并使用平行反應監測(PRM)方法檢測了20例患者和22例晚期肺腺癌患者的16個候選血清標志物。研究證實了DIA、MS和PRM相結合的方法在識別晚期肺腺癌患者的血清預測生物標志物方面是有效的。
使用技術:蛋白組學prm實驗檢測、PRM靶向蛋白質組學服務、蛋白組 prm外包公司


2. Clara I.et al: Ethylene Receptors, CTRs and EIN2 Target Protein Identification and Quantification Through Parallel Reaction Monitoring During Tomato Fruit Ripening.Front. Plant Sci.2020,IF=6.785.
【研究內容】:研究者為乙烯受體(ETR)及其下游組分CTR和EIN2的鑒定和定量,開發了一套包括樣品分離和平行反應監測結合質譜分析(PRM-MS)的研究方案。以番茄為模式果實,研究了果實成熟過程中乙烯信號轉導相關蛋白豐度的變化。研究證實了鑒定和絕對定量番茄四個成熟階段的七個乙烯受體、四分之三的CTR和EIN2的可行性。
使用技術:蛋白PRM定量技術服務、平行反應監測技術PRM、蛋白定量prm代做




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中文標題:靶向蛋白質組學在子宮內膜癌液體活檢診斷中的作用

發表期刊:Clinical Cancer Res

影響因子:12.531

運用技術:PRM靶向定量蛋白質組學(由輝駿生物提供技術支持)




● 內容概述


子宮內膜癌(EC)的診斷依賴于通過抽吸獲得的子宮內膜活檢組織(即子宮抽吸物)中腫瘤細胞的觀察,漏檢率達22%,50%的EC組織分型和級別被錯診。基于這種現狀,本研究意圖通過液體活檢檢測蛋白標志物的方式得到一種更加準確的診斷方式。通過最新一代的靶向質譜采集技術LC-PRM對子宮吸出液體的52個蛋白含量進行測定,在EC組和對照組以及EC壓型組運用邏輯回歸模型對數據進行處理,處理結果顯示MMP9和KPYM兩種蛋白組合能夠有效診斷EC AUC值為0.96,CTNB1、XPO2和CAPG聯合檢測能夠有效區分各壓型,AUC值為0.99。該研究為臨床診斷提供了非常好的候選標志物。



● 方法流程


本研究遵循的一般工作流程如圖所示。116例患者的子宮抽吸液處理一式兩份,并在混合四極軌道質譜儀上進行PRM采集分析。

 

在每個樣本中,先前研究(15)中優先考慮的52個候選生物標記物的相對豐度是通過對98個肽的分析來測量的。計算光譜相似性分數以確認多肽的同一性并檢測MS信號中的干擾。超過50%的樣本中沒有檢測到的五個肽被移除,導致總共有51個蛋白質被93個肽測量出來。通過重復樣品制備來評價分析流程的重復性,98%的檢測多肽的變異系數(CV%)低于15%,平均為3.6%。此外,來自同一蛋白質的多肽顯示出高度的相關性,因此,它們可以互換使用來評估蛋白質水平。只有三種蛋白(KPYM、OSTP和ROA2)的相關系數低于0.85,因為它們是由異構體特異性多肽監測的。這些多肽被認為來自不同的蛋白質。

 

圖片.png

 

引用文獻

 

Elena Martinez-Garcia. et al: Targeted Proteomics Identifies Proteomic Signatures in Liquid Biopsies of the Endometrium to Diagnose Endometrial Cancer and Assist in the Prediction of the Optimal Surgical Treatment. Cancer Res.  2017,IF=12.531.

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