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服務介紹應用案例常見問答

DIA定量蛋白質組學實驗原理


數據非依賴性掃描模式(Data-independent acquisition, DIA)是基于靜電場軌道阱Orbitrap帶來的一項全新的、全息式數據非依賴性采集定量技術,是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式。該技術將傳統蛋白質組的高通量和質譜絕對定量MRM/PRM的精確定量及高重復性等優點集于一體。
    
通過液質聯用技術(LC-MS/MS)將質譜整個全掃描范圍分為若干個窗口,高速、循環地對每個窗口中的所有離子進行選擇、碎裂及檢測,從而無遺漏、無差異地獲得樣本中所有離子的全部碎片信息;無需指定目標肽段,掃描點數均勻,利用譜圖庫即可實現定性確證和定量離子篩選,并可實現數據回溯。





DIA定量蛋白組學技術流程


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DIA定量蛋白質組學實驗技術應用


基礎醫學:疾病標志物,發病機制,疾病分型等;

生物醫藥:藥物機理,藥效評價,藥物開發等;

農林畜漁:抗逆脅迫,生長發育,耐藥,致病機理等。





DIA定量蛋白質組學實驗—輝駿服務優勢

1

近十年服務經驗,眾多服務案例,服務成果得到優秀期刊認可


2

對蛋白篩選與定量、低豐度蛋白鑒定方面有獨到見解,擅長針對客戶情況提出合適的方案建議


3

自有分子及細胞生物實驗平臺,能有效制定并執行最優的實驗路線


4

售后技術支持將一直保持到客戶發表文章,確保客戶安心進行下游實驗及投稿




聯系技術支持
18927549347





DIA定量蛋白組學實驗服務信息


項目名稱

客戶提供

結果交付

實驗周期

價格

DIA

原始樣本(-80℃保存,干冰運輸)
樣本信息表
分析要求

1、蛋白鑒定結果表
2、蛋白定量結果表
3、生物信息學分析結果
4、質譜原始數據
5、DIA實驗報告

5-6周









DIA定量蛋白質組學服務結果示例


生物信息學分析-輝駿生物


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DIA定量蛋白質組學實驗—客戶文獻


Bi F.F. et al: METTL9-SLC7A11 axis promotes hepatocellular carcinoma progression through ferroptosis inhibition. Cell Death Discov. 2023. IF=7.
使用技術:DIA全息掃描定量、dia實驗檢測



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Jarrett D. et al:Multiplexed peptide analysis using data-independent acquisition and Skyline.

Nature protocols. 2015, IF=17.021


中文標題:基于數據獨立采集和Skyline的多肽分析


運用技術:DIA非標定量蛋白質組學



圖片.png





● 內容概述


本研究描述了在Q-Exactive質譜儀上使用數據獨立采集(DIA)在Skyline靶向蛋白質組學環境下檢測和定量復雜混合物中的多肽。DIA對MS/MS光譜的系統獲取與DDA相反,DDA獲取的MS/MS光譜只適用于鑒定一組隨機采樣的多肽。與選擇性反應監測(SRM)類似,可以使用有針對性的色譜提取從DIA數據中定量多肽。與SRM不同,數據采集不限于預先確定的一組目標肽。在該方案中,使用數據依賴采集(DDA)生成光譜庫,并從庫中所有肽的DIA數據中提取色譜圖。與SRM類似,DIA數據的定量是基于提取的MS/MS色譜圖曲線下的面積。此外,還詳細介紹了一種適用于DIA的基于目標MS/MS采集的質量控制方法。

 



● 方法流程


數據獨立獲取(DIA)是一種相對較新的基于質譜的技術,用于系統收集串聯質譜數據。DIA獲取的數據集被描述為樣本的“分子快照”,因為該數據可以查詢任何可檢測到的肽,既可以監測多肽的存在,也可以監測樣品中多肽豐度的變化。因此,DIA非常適合研究人員需要測量數百種(或更多)蛋白質的應用,或者研究人員希望在不需要獲取額外數據集的情況下靈活地研究多個假設的應用。本研究描述了如何使用DIA獲取和分析用于肽分析的質譜數據。與選擇性反應監測(SRM)或平行反應監測(PRM)等靶向采集方法相比,DIA的方法設置更簡單,后者需要復雜的程序來測量約50個以上的肽。

 


DIA幾乎只用于“自下而上”的質譜分析,即在分析之前使用蛋白水解酶(例如胰蛋白酶)將蛋白質消化成多肽。與完整蛋白質相比,合成的多肽降低了理化多樣性,簡化了樣品制備,提高了質譜靈敏度(圖1)。消化后,肽通過反相高效液相色譜(RP-HPLC)分離,并通過電噴霧電離(ESI)接口直接發射到質譜儀。在捕集儀器(如Q-Exactive)上,傳輸到質譜儀的離子在短時間內被收集,并通過質譜(MS)或串聯質譜(MS/MS)進行分析。


圖片.png

 

沒有“一刀切”的DIA方法。設計最佳DIA方法的一些關鍵考慮因素是樣品復雜性、色譜條件、所使用的質譜儀以及所需的靈敏度。DIA方法的許多參數可能需要根據實驗進行調整。DIA方法的一些關鍵性能特征包括:MS/MS隔離寬度、色譜采樣率、M/Z覆蓋范圍、分辨率、質量精度、AGC目標和最大離子注入時間、樣品注射次數等。

蛋白質定量DIA和傳統的非標記定量有何優勢?

傳統的非標記定量一般需要通過分級的方法開展,耗時久、重復性差、數據結果可信度不高;蛋白定量DIA技術是新一代非標記定量技術,可通過更優的數據采集模式,在相同時間采集到更豐富的信息,壓縮周期的同時,大福度提高樣本間平行比較的重復性,數據結果可信度極高。


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